Institute of Chemistry

Universidade Federal do Rio de Janeiro

 

 

Current Members

Former Members

Research

Facilities

Academics

Calendar

Group Seminars

Forum of Scientific Discussions

Contact Information

Department News

Positions Open

 

Home

Site Map



 

Dicas Interlab

Home > Research > Interlab > Interno

Dicas

 

Lema

"Quem vem de baixo, meu caro, deve varar com fé, pois age contra a gravidade"

(Heitor Villa-Lobos)

 

Literatura

Fazer pesquisa de qualidade requer pelo menos 50% do tempo dedicado à leitura e saber o que acontece na sua área. Assim, dedique uma manha da sua semana para acompanhar o que sai nos vários periódicos. Abaixo você pode encontrar

 

 

Tutoriais

Muitas vezes bons tutoriais e ler os artigos clássicos nos ajudam sobremaneira nas nossas tarefas. Abaixo vão alguns deles, que eu selecionei para voces.

 

Química Teórica/Modelagem Molecular

 

Experimental

 

Oficinas

Diminua a burocracia. Para a confecção/reparo para o laboratório procure diretamente as oficinas do IQ. Mantenha laboratório sempre em ordem. Qualquer problema maior falar com alguém mais antigo no lab ou com Pierre.

 

Serviços de Espectroscopia

Diminua a burocracia. Para a obtenção de espectros preencha diretamente as requisições.

  • RMN - para espectro de 1H e 13C. É necessário levar o tubo de RMN pronto.
  • Infravermelho e NIR - Falar com a Leo (lab 628)
  • Massas - Falar com Profa. Débora (lab 603).

 

Comandos Cluster (para comandos básicos UNIX-Linux consulte: http://www.ss64.com/bash/)

  • sinfo - Visualizador do cluster
  • qmon - Interface gráfica para o sistema de filas
  • qdel numero_processo_PID - Apaga job de numero numero_processo_PID da fila
  • qstat - Vê fila
  • qstat -r - Vê jobs detalhados na fila
  • qstat -r -u usuário - Vê jobs detalhados do usuário usuário na fila
  • qstat -r -u usuário -s z - Vê jobs do usuário usuário que terminaram.
  • qg03 nome_arquivo - Submete calculo nome_arquivo.inp para Gaussian para a fila
  • gall nome_arquivo - Gera resumo do cálculo Gaussian (U, ZPE, H(298)-H(0), S e Nimag)
  • gall1 nome_arquivo - Gera resumo do cálculo Gaussian (H(298), S(298) e G(298))
  • g98_resumo nome_arquivo - Gera resumo do cálculo Gaussian (geometria + outras informações)
  • qgms nome_arquivo - Submete calculo nome_arquivo.inp para GAMESS US para a fila
  • scp -r usuário@nó1:diretório1/arquivo1 usuário@nó2:diretório2/arquivo2 - Copia o(s) arquivo(s) 1 do usuário do nó1 para o diretório2 recursivamente
  • ssh -X -A nó - Shell segura para
  • molden - Interface gráfica para cálculos ab initio
  • vmd - Outro visualizador, excelente para cálculos de dinâmica molecular
  • xmgrace - Programa para fazer gráficos (tipo Origin)

 

Manuais

Para pensar

 


 

Last Update:

Site contact:pesteves@iq.ufrj.br

Top     Home     Site Map